Fakultas Kedokteran Universitas Muhammadiyah Semarang ( FK UNIMUS ) melakukan kerjasama aktif yang berkelanjutan guna mendukung penguatan caturdarma yaitu: pendidikan, penelitian, pengabdian masyarakat dan Al Islam Kemuhammadiyahan (AIK) , yang berkontribusi dalam pencapaian peningkatan derajat kesehatan masyarakat. Untuk mendukung dan memfasilitasi visi misi di bidang kedokteran komunitas, FK UNIMUS menjalin kerjasama denan berbagai puskesmas, kelompok komunitas, desa binaan, masjid dan majelis taklim. Selain itu FK UNIMUS juga bekerja sama dengan berbagai RS seperti RSU Tugurejo, RSUD Amino Gondohutomo, RS Muhammadiyah Roemani, dan berbagai RS PKU Muhammadiyah di Jawa Tengah yang lain.
Kerjasama dengan RS dan fasilitas kesehatan ini memperkuat kegiatan Pendidikan, pengabdian masyarakat dan penelitian, sekaligus membantu pemerintah dalam meningkatkan derajat kesehatan masyarakat.
Beberapa kerjasama yang sudah di jalin oleh FK UNIMUS , seperti
- Eurasian Forum for Occupational Health (EAFFOH)
- Hubei University, China
- Universiti Kebangsaan Malaysia (UKM) Komunitas Sahabat mata
- Forum kesehatan komunitas kelurahan sendangmulo
Selain menjalin kerjasama yang luas FK UNIMUS juga tergabung dalam organisasi APKKM ( asosiasi Pendidikan Kedokteran dan Kesehatan Muhammadiyah ) yang kita ketahui bahwa organisasi muhammadiyah sudah terkenal di kanca Nasional hingga Internasional, hal ini sangat menunjang kegiatan catur darma FK UNIMUS.