Dalam menunjang kegiatan publikasi dosen dan mahasiswa di lingkungan FK Unimus. Fakultas memiliki beberapa fasilitas yang dapat diakses dalam melakukan publikasi ilmiah. Adapun fasilitas tersebut meliputi:
- Jurnal Medica Arteriana, terbit 2x dalam 1 tahun, memuat artikel tentang ilmu kedokteran dasar, ilmu kedokteran klinis, dan ilmu kesehatan komunitas (kesehatan masyarakat, kedokteran okupasi, dan kedokteran keluarga). https://jurnal.unimus.ac.id/index.php/MedArt
- Jurnal Surya Masyarakat, terbit 2 (dua) kali dalam satu tahun yang memuat artikel-artikel pengabdian masyarakat. https://jurnal.unimus.ac.id/index.php/JSM
- Seminar Nasional Unimus merupakan wadah publikasi hasil-hasil penelitian dan pengabdian masyarakat yang diselenggarakan oleh Unimus setiap tahun. http://semnas.unimus.ac.id/
Selain itu fakultas juga memfasilitasi publikasi pada jurnal ilmiah yang merupakan afiliasi Perguruan Tinggi Muhammadiyah se Indonesia
